Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG64

Fkrp, Fukutin-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FkrpQ8CG64 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FkrpQ8CG64 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FkrpQ8CG64 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FkrpQ8CG64 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FkrpQ8CG64 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FkrpQ8CG64 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FkrpQ8CG64 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FkrpQ8CG64 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FkrpQ8CG64 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FkrpQ8CG64 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FkrpQ8CG64 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms