Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc63Q8CDV6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms