Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb2Q8CC27 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms