Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TiparpQ8C1B2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms