Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pggt1bQ8BUY9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms