Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS39

Ccdc32, Coiled-coil domain-containing protein 32, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc32Q8BS39 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc32Q8BS39 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc32Q8BS39 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms