Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms