Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms