Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms