Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPY4

Pramel5, Pramel5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel5Q7TPY4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pramel5Q7TPY4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramel5Q7TPY4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms