Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn2Q6PHP6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Lrrn2Q6PHP6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Lrrn2Q6PHP6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn2Q6PHP6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms