Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms