Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc3bQ6NWW9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms