Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlrp9cQ66X01 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms