Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms