Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms