Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms