Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Ss18Q62280 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ss18Q62280 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ss18Q62280 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ss18Q62280 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ss18Q62280 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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