Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd53Q61451 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms