Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamb3Q61087 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms