Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms