Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf3Q5HZG4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms