Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms