Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms