Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opa3Q505D7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms