Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms