Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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