Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk4Q3V129 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk4Q3V129 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk4Q3V129 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk4Q3V129 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk4Q3V129 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk4Q3V129 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk4Q3V129 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk4Q3V129 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ulk4Q3V129 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ulk4Q3V129 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms