Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms