Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd4Q3UTY6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms