Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms