Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cog7Q3UM29 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms