Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam5Q3UKK2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam5Q3UKK2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms