Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms