Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trafd1Q3UDK1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms