Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms