Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms