Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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