Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms