Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms