Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms