Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms