Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb1Q02819 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms