Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms