Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb4Q02738 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb4Q02738 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms