Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms