Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms