Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms