Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps17P63276 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps17P63276 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps17P63276 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps17P63276 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms