Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2lP62876 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms